Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SelenooQ9DBC0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SelenooQ9DBC0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SelenooQ9DBC0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SelenooQ9DBC0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SelenooQ9DBC0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SelenooQ9DBC0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SelenooQ9DBC0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SelenooQ9DBC0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SelenooQ9DBC0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SelenooQ9DBC0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SelenooQ9DBC0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SelenooQ9DBC0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SelenooQ9DBC0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SelenooQ9DBC0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SelenooQ9DBC0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SelenooQ9DBC0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SelenooQ9DBC0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelenooQ9DBC0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelenooQ9DBC0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelenooQ9DBC0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelenooQ9DBC0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelenooQ9DBC0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelenooQ9DBC0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelenooQ9DBC0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelenooQ9DBC0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelenooQ9DBC0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms