Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB85

Rrp8, Ribosomal RNA-processing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp8Q9DB85 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rrp8Q9DB85 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rrp8Q9DB85 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rrp8Q9DB85 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rrp8Q9DB85 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rrp8Q9DB85 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp8Q9DB85 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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