Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sgf29Q9DA08 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms