Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms