Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q9D8Q6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms