Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc52a2Q9D8F3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slc52a2Q9D8F3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slc52a2Q9D8F3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slc52a2Q9D8F3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc52a2Q9D8F3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms