Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Nop56Q9D6Z1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Nop56Q9D6Z1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nop56Q9D6Z1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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