Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc9bQ9D6E4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms