Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc39Q9D5Y1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc39Q9D5Y1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms