Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fam227bQ9D518 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fam227bQ9D518 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms