Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Gm3404Q9D506 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Gm3404Q9D506 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Gm3404Q9D506 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Gm3404Q9D506 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Gm3404Q9D506 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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Gm3404Q9D506 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gm3404Q9D506 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gm3404Q9D506 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gm3404Q9D506 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gm3404Q9D506 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gm3404Q9D506 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gm3404Q9D506 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gm3404Q9D506 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3404Q9D506 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms