Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc105Q9D4K7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms