Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms