Protein–RNA interactions for Protein: Q9D411

Tssk4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk4Q9D411 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tssk4Q9D411 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tssk4Q9D411 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tssk4Q9D411 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tssk4Q9D411 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms