Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
4933428G20RikQ9D3X4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms