Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rsph14Q9D3W1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms