Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q9D3J9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D3J9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q9D3J9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms