Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9D2Q3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms