Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Chordc1Q9D1P4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms