Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SarnpQ9D1J3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms