Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1F3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1F3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1F3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D1F3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D1F3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms