Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hddc3Q9D114 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116 ms