Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Exosc7Q9D0M0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms