Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spc24Q9D083 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spc24Q9D083 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spc24Q9D083 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spc24Q9D083 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spc24Q9D083 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spc24Q9D083 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spc24Q9D083 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spc24Q9D083 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spc24Q9D083 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spc24Q9D083 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spc24Q9D083 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Spc24Q9D083 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spc24Q9D083 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Spc24Q9D083 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spc24Q9D083 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms