Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf146Q9CZW6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf146Q9CZW6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms