Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xrcc3Q9CXE6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms