Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms