Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CWU4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CWU4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CWU4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CWU4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms