Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd12Q9CWU0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms