Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWB5

Pgpep1l, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1lQ9CWB5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Pgpep1lQ9CWB5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Pgpep1lQ9CWB5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Pgpep1lQ9CWB5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Pgpep1lQ9CWB5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Pgpep1lQ9CWB5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Pgpep1lQ9CWB5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Pgpep1lQ9CWB5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Pgpep1lQ9CWB5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pgpep1lQ9CWB5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Pgpep1lQ9CWB5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms