Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sycp2Q9CUU3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Sycp2Q9CUU3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms