Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhobtb3Q9CTN4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms