Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snw1Q9CSN1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snw1Q9CSN1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms