Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q9CR55 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CR55 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CR55 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CR55 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CR55 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CR55 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CR55 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CR55 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CR55 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CR55 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CR55 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CR55 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CR55 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CR55 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CR55 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CR55 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CR55 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CR55 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CR55 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CR55 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CR55 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CR55 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CR55 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CR55 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CR55 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CR55 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CR55 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CR55 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q9CR55 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CR55 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CR55 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CR55 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CR55 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CR55 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CR55 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CR55 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CR55 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CR55 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CR55 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CR55 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CR55 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CR55 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CR55 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CR55 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CR55 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CR55 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CR55 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CR55 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CR55 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CR55 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CR55 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CR55 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q9CR55 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CR55 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CR55 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CR55 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CR55 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CR55 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CR55 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CR55 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CR55 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CR55 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CR55 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CR55 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CR55 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CR55 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CR55 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CR55 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CR55 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CR55 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CR55 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CR55 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q9CR55 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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