Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tma16Q9CR02 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms