Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PclafQ9CQX4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PclafQ9CQX4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms