Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Nicn1Q9CQM0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Nicn1Q9CQM0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Nicn1Q9CQM0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Nicn1Q9CQM0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Nicn1Q9CQM0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Nicn1Q9CQM0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Nicn1Q9CQM0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Nicn1Q9CQM0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Nicn1Q9CQM0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Nicn1Q9CQM0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Nicn1Q9CQM0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nicn1Q9CQM0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms