Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Znhit3Q9CQK1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znhit3Q9CQK1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znhit3Q9CQK1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znhit3Q9CQK1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znhit3Q9CQK1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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