Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nudt21Q9CQF3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nudt21Q9CQF3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms