Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnaseh2cQ9CQ18 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms