Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Krt88Q9CPR6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Krt88Q9CPR6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Krt88Q9CPR6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Krt88Q9CPR6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Krt88Q9CPR6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Krt88Q9CPR6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Krt88Q9CPR6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt88Q9CPR6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Krt88Q9CPR6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Krt88Q9CPR6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Krt88Q9CPR6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt88Q9CPR6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt88Q9CPR6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Krt88Q9CPR6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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