Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bhlhe41Q99PV5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms