Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rrbp1Q99PL5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rrbp1Q99PL5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rrbp1Q99PL5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rrbp1Q99PL5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rrbp1Q99PL5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rrbp1Q99PL5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Rrbp1Q99PL5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rrbp1Q99PL5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rrbp1Q99PL5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Rrbp1Q99PL5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rrbp1Q99PL5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rrbp1Q99PL5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms