Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim8Q99PJ2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim8Q99PJ2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim8Q99PJ2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim8Q99PJ2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim8Q99PJ2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim8Q99PJ2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim8Q99PJ2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim8Q99PJ2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim8Q99PJ2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim8Q99PJ2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim8Q99PJ2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim8Q99PJ2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim8Q99PJ2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim8Q99PJ2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim8Q99PJ2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim8Q99PJ2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim8Q99PJ2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim8Q99PJ2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim8Q99PJ2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim8Q99PJ2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim8Q99PJ2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim8Q99PJ2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim8Q99PJ2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim8Q99PJ2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim8Q99PJ2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim8Q99PJ2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim8Q99PJ2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim8Q99PJ2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms