Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rims1Q99NE5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rims1Q99NE5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rims1Q99NE5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rims1Q99NE5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rims1Q99NE5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rims1Q99NE5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rims1Q99NE5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rims1Q99NE5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rims1Q99NE5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms