Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
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Hdac9Q99N13 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Hdac9Q99N13 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac9Q99N13 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Hdac9Q99N13 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Hdac9Q99N13 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac9Q99N13 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Hdac9Q99N13 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac9Q99N13 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac9Q99N13 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac9Q99N13 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac9Q99N13 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac9Q99N13 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac9Q99N13 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac9Q99N13 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hdac9Q99N13 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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