Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gins4Q99LZ3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gins4Q99LZ3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms