Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Gdpd3Q99LY2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms