Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nus1Q99LJ8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms