Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms